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发布日期:2024-03-17 11:14  点击次数:63
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  中新网北京7月12日电 (记者 孙自法)国外有名学术期刊《当然》最新在线发表一篇结构生物学论文称,商讨东说念主员垄断东说念主工智能(AI)期间驱动,研发出一种能想象新卵白质的深度学习治安,这个名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion)的深度学习治安能生成多样功能性卵白质,包括在自然卵白质中从未见过的拓扑结构。

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  该论文先容,深度学习鼓励了卵白质结构的展望和想象,但仍需一个通用框架来克服在卵白质想象上遭遇的多样挑战。扩散模子是一种生成式模拟治安,已被诠释在图像和文本生成中很有效,而况似乎也适用于卵白质想象。可是,这类模子当今的告捷率并不高,产生的序列基本弗成折叠成打算结构。

  论文通信作家、好意思国华盛顿大学David Baker和共事及协作家开展商讨标明,通过细调之前报说念过的RoseTTAFold的结构展望网罗并将其整合到一个降噪扩散模子中,就能生成具有实质好奇艳羡好奇艳羡好奇艳羡好奇艳羡的卵白质骨架,而卵白质骨架决定了卵白质的体式和功能。该模子(RFdiffusion)能测试领有不同结构元素的想象组合,并从新启动产生卵白质。RFdiffusion能现实不同的任务,想象单体(卵白质的基本构成单元)、寡聚体(多亚基聚体)和有诊疗或工业应用出息的复杂结构,如调和位点。

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  论文作家对数百个想象出的对称聚体、金属调和卵白和调和卵白的结构和功能进行了实验表征,诠释了该治安的实用性。他们还生成了想象的一种调和卵白与其底物(此处为流感血凝素——在流感病毒名义发现的卵白)的复合物并分析了其结构,发现成果与想象的模子着实一模相通,从而诠释了该治安的准确性。

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  论文作家转头以为开云棋牌,RFdiffusion是对当今卵白质想象治安的一次轮廓变嫌,能产生总长度达600个残基的结构,复杂性和准确度齐比之前更高。后续对该治安的进一步变嫌,或能想象出复杂经由更高的新卵白。(完)



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